Posizioni di bioinformatico con competenze in genomica funzionale di procarioti @UniRomaTre

28/07/2021

Presso il Dipartimento di Scienze dell’Università Roma Tre, nel laboratorio di Microbiologi Molecolare diretto dal Prof. Paolo Visca (E-mail: paolo.visca@uniroma3.it; Skype: paolo.visca; https://orcid.org/0000- 0002-6128-7039) sono disponibili posizioni di Dottorato di Ricerca e un assegno di ricerca pluriennale per ricerche in tema di genomica funzionale di procarioti.

I candidati per le posizioni di dottorato di ricerca devono essere in possesso di laurea magistrale attinente al tema generale della ricerca (Biologia con indirizzo bioinformatico, Bioinformatica, Fisica con indirizzo biofisica, Ingegneria informatica, Informatica ecc.) e devono avere maturato una esperienza pratica in ambito bioinformatico durante la preparazione della tesi magistrale. Specifiche competenze richieste: Uso di ambienti linux e almeno un linguaggio di programmazione (Perl, Python, R); conoscenza di procedure bioinformatiche di analisi dati, banche dati biologiche e accesso programmatico a tali risorse; esperienza nell’analisi di dati da next generation sequencing.
La durata del dottorato è 3 anni e l’importo mensile della borsa è circa 1.150 euro. Il bando di concorsuale si apre a giugno di ogni anno.

I candidati per la posizione di assegno di ricerca pluriennale devono avere svolto un dottorato di ricerca strettamente attinente al tema generale della ricerca, documentato da adeguate pubblicazioni scientifiche. Specifiche competenze richieste:
Oltre alle competenze sopra indicate per i dottorandi, si richiede esperienza documentabile nell’analisi di dati “omics”, in particolare resequencing, de novo sequencing, analisi metagenomica (16S e ITS) e conoscenza di procedure bioinformatiche di analisi dati (es.: paired-end reads alignment, data filtering, variant calling). Costruzione e analisi di MAGs (metagenome-assembled genomes). Esperienza in assembly e annotazione di genomi batterici. Esperienza nell’analisi di resistenze batteriche, elementi trasponibili, plasmidi e analisi filogenetica. Esperienza nello sviluppo di pipeline di bioinformatica. Classificazione tassonomica, studi di genomica comparativa.

La durata dell’assegno è annuale rinnovabile fino a un massimo di 6 anni e l’importo del salario mensile varia da circa 1.450 circa 1.600 euro. Il bando di concorsuale sarà a ottobre 2021 (pubblicazione sul sito https://app.scienze.uniroma3.it/acts?typology=4).

Per contatti preliminari fare riferimento al responsabile delle ricerche Prof. Paolo Visca
(https://orcid.org/0000-0002-6128-7039):
E-mail: paolo.visca@uniroma3.it
Skype: paolo.visca

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